故事发生在上一季结束三年之后。在这一季中，男主角变成了CTU的领导者，他的伴侣也成为了特工队的一员，而他的女儿则加入了情报分析的行列。剧情以一具因感染致命病毒而被遗弃在洛杉矶一家卫生中心外的尸体作为开端。一名墨西哥毒贩试图利用一场生化威胁，逼迫美国政府释放他的兄弟。男主角在追查此事时，再次面临巨大危险，为了潜入毒贩内部，他甚至不得不染上毒瘾，增加了调查的难度。同时，白宫方面，连任的总统在康复后，身边出现了一位私人医生女友，而他的弟弟也成为了他的信赖助手。在应对连任压力与这场危机的双重挑战中，未来仍充满未知。