某个小岛上，红虫成为了一种流行病，被咬到的人会出现皮肤瘙痒、高烧甚至生命危险的症状！岛上的居民坚信巫师巴达（黄宗迅）和大头目的力量，而不相信医学。年轻医生何维德（张冲）经过学习后到达蘭嶼，一方面为居民们治病，同时也在寻找早先去蘭嶼研究红虫的父亲，这也导致他与未婚妻白丹娜（何莉莉）产生了争执。在蘭嶼，何遇见了神父纪（纪守常）和孤女雅兰（郑佩佩）。雅兰爱上了何，这引起了大头目的儿子西呼达（王侠）的嫉妒，同时，何的医治行动也导致了巴达的信众日渐减少，西呼达和巴达都在等待着机会杀害何。何和雅兰前往红头峰森林寻找何的父亲，在此过程中不知不觉陷入了危险之中......