小智和他的宝可梦伙伴们一直在旅途中前行，日复一日。某天，天空中突然出现一个陌生的宝可梦，名叫波尔凯尼恩。波尔凯尼恩不得不与小智被一根神奇的锁链连接在一起。波尔凯尼恩一直对人类心怀怨恨，因为他曾受到人类的伤害，但现在他与小智注定要共同面对一个未知的命运，开始了一段奇幻而不可思议的冒险。 与此同时，在阿佐特王国的超级机关城市，大臣贾维斯终于得到了他一直追求的终极发明——一只古老而强大的人造宝可梦玛机雅娜。这只玛机雅娜在500年前就在阿佐特王国诞生，传说它身体内蕴藏着一股神秘的力量，被称为"魂心"。贾维斯贪婪地计划利用这股力量来统治王国，将所有权力都握在自己手中。 小智、皮卡丘和波尔凯尼恩意外发现，波尔凯尼恩和玛机雅娜之间似乎有着某种神秘的联系。他们决定合力解开这个谜团，为了阿佐特王国的未来与贾维斯展开一场惊心动魄的决战。 在这场史上最伟大的精灵宝可梦之战中，小智和他的伙伴们将面对前所未有的艰难考验。他们需要找到解开锁链的方法，同时解开波尔凯尼恩与玛机雅娜之间的秘密。他们将面对贾维斯以及他军团的挑战，最终决定阿佐特王国和所有宝可梦的命运。这是一段关于勇气、友谊和自我牺牲的故事，也是一场永远不会被遗忘的冒险。