电影《暗影花》主要讲述香港演员万文芳遭遇暗杀的故事。才华横溢的律师沈一萍（周迅饰）接手这个案件，并决定展开调查。然而，在她调查的过程中，她意外发现，这个案件的检察官竟是她曾经深爱过的吴正为（吴镇宇饰）。同时，沈一萍通过深入调查发现了许多可疑之处。为了寻求真相，她决定去男孩家中调查，却意外陷入了一系列凶手制造的陷阱之中。