故事旁白从雷克斯·路瑟开始，描绘着超人作为一位英雄的形象和壮举。雷克斯描绘超人是地球上的一位神明，但他坚持认为“即使神也会在他应该来世的时候死去”。 超人和露意丝·莲恩正在享受浪漫的约会，但露意丝对他们的关系尤其在孤独堡垒中保密并不满意。超人坚持认为他们的关系应该在秘密中进行，并没有向她透露他真实身份是克拉克·肯特，尽管露意丝已经开始怀疑。 与此同时，雷克斯公司发现了一艘太空船，而当工人在挖掘过程中不小心释放出基因改造的凶残怪兽末日杀手。末日杀手杀死了所有的工人，并在进城的路上屠宰了无辜的鹿、狗和狗的主人。末日杀手最终被超人发现，并与他展开了一场激烈的战斗。最终，超人将末日杀手从高空抓住，一起坠落到地面上。露意丝和同事吉米·奥尔森告诉人们超人成功击败了敌人，但同时也因伤势过重而失去了生命。 全世界集体哀悼倒下的英雄，并在公园中建立了超人的纪念碑。后来，雷克斯为了确保没有人知道他和末日杀手的存在，残忍地杀害了他的女助手。吉米对超人的死感到难过，并突然转到了另一家报社工作。超人的死导致犯罪率上升，而玩具人操纵着巨大的机械蜘蛛，并将一辆装满孩子的校车挟持在屋顶上。露意丝决定救出人质，并独自前往，但在危急关头，超人意外地出现，制服了玩具人。露意丝兴高采烈地与复活的超人亲吻，但超人的养母玛莎开始对他为什么没有电话回家感到怀疑，而露意丝也觉得他有些奇怪。 后来揭示出复活的超人其实是雷克斯制造的克隆人，雷克斯在超人与末日杀手的战斗中收集了超人的血液，因此他可以控制复制超人。雷克斯将复制超人引到一间充满红色太阳光的房间，并戴上氪石手套不断殴打他，发泄自己的怨恨。打完后，雷克斯去看了他私自挖掘出来的超人本尊的尸体。然而，超人仍然活着，并被超人的机器人助手秘密转移到了孤独堡垒中以恢复力量。 复制超人在看到玩具人在逃狱后杀死了一名4岁女孩的报道时，性格突然变得阴暗，并立刻前去将玩具人杀死。此举让他周围的人感到困惑，警察也开始追捕他，露意丝认为他可能不是真正的超人。后来，露意丝和吉米发现了雷克斯想要复制超人的军队计划，在雷克斯计划解决他们之际，复制超人突然出现帮助两人，并摧毁了所有的复制超人试管。复制超人还将他体内的铅氪石拿出来，使雷克斯无法控制他。 另一方面，真正的超人在机器人助手的帮助下逐渐恢复力量，但听到关于军队与复制超人开战的消息后，他立即赶往现场。然而，由于只恢复了60％的力量，机器人给他穿上了黑色超人服，并交给他氪石枪。超人和复制超人展开了一场激烈的战斗，超人的氪石枪被打飞到远处，他一直处于下风。露意丝捡起氪石枪，打算射击复制超人，但被破坏了。然而，氪石罐掉落了出来。复制超人在将超人打倒时举起纪念碑准备结束他，超人用热力射线击碎了复制超人胸口的氪石罐，释放出大量的氪气，最终击败了复制超人。在临死之前，复制超人告诉超人要保护人民。露意丝确认他是真正的超人，并与他亲吻，同时也赢得了其他人的信任。 超人来到露意丝的公寓，发现她文章中拼错的“复活”一词，并戴上眼镜，表示自己就是克拉克。露意丝高兴地拥抱了他。在雷克斯公司，雷克斯以前被复制超人重伤，但仍然存活，并思考着如何摧毁超人。历史已经证明，神明可以死去，但他们也可以从死亡中复活。雷克斯对此微笑并深思，意味着他正考虑着如何对抗超人。